Développement de thérapies contre le cancer et de médicaments modernes

Le Collège de doctorat « Peptides bioactifs » étudie les structures complexes des peptides et leur fonction. La Deutsche Forschungsgemeinschaft approuve la deuxième phase et finance la recherche à hauteur de 2,1 millions d'euros.

En biochimie et en recherche de médicaments, les peptides naturels et synthétiques jouent un rôle important, notamment dans le développement de nouveaux médicaments modernes ainsi que dans l'identification des points d'attaque où les substances actives se fixent. Le Collège de doctorat « Peptides bioactifs – Aspects innovants de la synthèse et de la biosynthèse » (RTG2473/1) étudie la structure complexe des peptides et leur fonction. La Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) soutient cette recherche du 1er octobre 2023 au 31 mars 2028, pour une période supplémentaire de quatre ans et demi, avec un financement d'environ 2,1 millions d'euros. Le collège de doctorat entre ainsi dans sa deuxième phase de financement. La TU Berlin reste l'université porteuse. Le porte-parole du collège, qui mène des recherches dans les domaines de la biologie moléculaire, de la biochimie, de la chimie biologique et de la bioanalytique, est le Prof. Dr. Roderich Süssmuth. Il occupe depuis 2004 la chaire Rudolf-Wiechert de chimie biologique à la TU Berlin et dirige le département éponyme. Au total, la DFG a approuvé onze nouveaux collèges de doctorat et en a prolongé neuf existants.

Les peptides sont généralement des molécules en chaîne, composées de deux à 100 acides aminés, éléments essentiels de toutes les cellules vivantes. Les fonctions variées des peptides sont principalement déterminées par leur structure moléculaire parfois complexe et leur repliement spatial, dont la caractérisation constitue une partie essentielle des recherches du collège de doctorat. L’analyse des mécanismes de biosynthèse et des voies de signalisation possibles de certains peptides exemplaires représente d’autres défis et questions centrales du collège « Peptides bioactifs ». Les systèmes modèles et donc l’origine des peptides étudiés sont variés : parmi eux, on trouve des peptides issus de cyanobactéries photosynthétiques, de champignons, de champignons forestiers ou de bactéries synthétisant des toxines végétales. Une caractéristique particulière du collège est son interdisciplinarité. Quasi tous les projets coopèrent avec d’autres partenaires du consortium.

Lors de la première période de financement, des substances actives peptidiques telles que le poison du champignon amanite phalloïde ont été synthétisées chimiquement, et leurs structures spatiales ont été caractérisées par des méthodes analytiques et théoriques-chimiques. Ces découvertes alimentent la recherche sur le développement de thérapies contre le cancer. Un autre projet concerne l’étude du mécanisme d’action d’un toxine bactérienne végétale agissant sur la gyrase, une enzyme qui sépare et recolle les extrémités de l’ADN. Cette substance active est actuellement utilisée pour évaluer son potentiel en tant qu’antibiotique dans le traitement des infections bactériennes.

Dans la deuxième phase de financement, l’accent de la recherche interdisciplinaire restera sur la compréhension des mécanismes de biosynthèse peptidiques, des structures moléculaires, des voies de transport et des interactions avec les cibles. Afin de répondre aux besoins en méthodes informatisées, le consortium de la deuxième période de financement sera complété par la Prof. Dr. Han Sun, qui mène des recherches en biologie structurale et en biophysique à l’Institut Leibniz de pharmacologie moléculaire de Berlin et à la TU Berlin.

Dans le cadre du programme de doctorat, des doctorantes et doctorants reçoivent une formation interdisciplinaire complète et didactique sur la recherche en peptides. Le contenu pédagogique couvre les domaines clés de la biologie moléculaire/ biochimie, de la chimie de synthèse et de la bioanalytique/structure moléculaire. « Au cours des dernières années, la recherche sur les peptides a acquis une importance particulière dans la recherche académique et industrielle. Il existe donc une demande croissante et durable de chercheurs bien formés et compétents, capables de comprendre et de parler la langue de l’autre discipline », explique le Prof. Dr. Roderich Süssmuth.

En plus de la TU Berlin, la deuxième période de financement implique également la FU Berlin, la HU de Berlin, l’Université de Potsdam et l’Institut de recherche en pharmacologie moléculaire de Berlin-Buch. La corps professoral est complété par la contribution de chercheurs de renom international en science des peptides, issus des universités et de l’industrie. Des chercheurs seniors expérimentés agissent en tant que conseillers au sein du collège de doctorat.

Pour de plus amples informations, n’hésitez pas à contacter :

Prof. Dr. Roderich Süssmuth
TU Berlin
Département de chimie biologique
Tél. : 030/314-24205
E-mail : roderich.suessmuth@tu-berlin.de

Maria Seidel
TU Berlin
Département de chimie biologique
Tél. : 030/314-73742
E-mail : maria.seidel@tu-berlin.de