Ontwikkeling van kankerbehandelingen en moderne medicijnen

De Graduate School „Bioactive Peptides“ onderzoekt de complexe structuren van peptiden en hun functies. De Deutsche Forschungsgemeinschaft keurt de tweede fase goed en financiert het onderzoek met 2,1 miljoen euro.

In de biochemie en de geneesmiddelenonderzoek spelen natuurlijke en synthetische peptiden een belangrijke rol, vooral bij de ontwikkeling van nieuwe moderne medicijnen en de identificatie van aanvalspunten waar de werkzame stoffen zich aan binden. De Graduate School „Bioactive Peptides – Innovative Aspects of Synthesis and Biosynthesis“ (RTG2473/1) onderzoekt de complexe structuur van peptiden en hun functies. De Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) financiert dit onderzoek van 1 oktober 2023 tot 31 maart 2028 voor nog vier en een halve jaar met een subsidie van ongeveer 2,1 miljoen euro. Hiermee gaat de graduate school haar tweede financieringsfase in. De TU Berlijn blijft de leidende universiteit. De woordvoerder van de school, die onderzoek doet op het gebied van moleculaire biologie, biochemie, biologische chemie en bioanalyse, is Prof. Dr. Roderich Süssmuth. Hij bekleedt sinds 2004 de Rudolf-Wiechert-Professor voor Biologische Chemie aan de TU Berlijn en leidt het gelijknamige vakgebied. In totaal heeft de DFG elf nieuwe en negen verlengde bestaande graduate schools goedgekeurd.

Peptiden zijn meestal ketenvormige moleculen die bestaan uit twee tot honderd aminozuren, de essentiële bouwstenen van alle levende cellen. De diverse functies van peptiden worden vooral bepaald door hun soms complexe moleculaire structuur en driedimensionale vouw, waarvan de karakterisering een essentieel onderdeel is van het onderzoek van de graduate school. De analyse van biosynthese-mechanismen en mogelijke signaaloverdrachtwegen van geselecteerde voorbeeldpeptiden vormen verdere uitdagingen en centrale vragen van de graduate school „Bioactive Peptides“. De modelsystemen en daarmee de herkomst van de onderzochte peptiden zijn divers: onder andere stammen de peptiden van fotosynthetiserende cyanobacteriën, schimmel, bosbessen of bacteriën die giftige stoffen synthetiseren. Een bijzonder kenmerk van de graduate school is de interdisciplinaire aanpak. Bijna alle projecten werken samen met andere partners uit het consortium.

In de eerste financieringsperiode werden peptidische werkzame stoffen, zoals het gif van de knopzwam, het amanitin, chemisch gesynthetiseerd en de driedimensionale structuren gekarakteriseerd met analytische en theoretisch-chemische methoden. Deze bevindingen worden gebruikt in onderzoek naar de ontwikkeling van therapieën tegen kanker. Een ander project richt zich op het werkingsmechanisme van een bacterieel plantengif met gyrase, een enzym dat de uiteinden van DNA scheidt en weer aan elkaar koppelt. Deze werkzame stof wordt momenteel gebruikt om te beoordelen of het geschikt is als antibioticum voor de behandeling van bacteriële infecties.

Ook in de tweede financieringsfase blijft de focus van het interdisciplinaire onderzoek liggen op het ontrafelen van peptidische biosynthese-mechanismen, moleculaire structuren, transportwegen en targetinteracties. Om te voldoen aan de vraag naar computergestuurde methoden wordt het consortium voor de tweede financieringsperiode aangevuld met professorin Dr. Han Sun, die onderzoek doet aan het Leibniz-onderzoeksinstituut voor Moleculaire Farmacologie in Berlijn en aan de TU Berlijn op het gebied van structurele biologie en biofysica.

In het kader van het graduate programma worden promovendi - didactisch gestructureerd - uitgebreid geïnformeerd over interdisciplinaire inhoudelijke kennis over peptidenonderzoek. De onderwijsinhoud bestaat uit de kerngebieden moleculaire biologie/biochemie, synthesechemie en bioanalyse/structurele biologie. „In de afgelopen jaren heeft peptidenonderzoek een bijzondere betekenis gekregen in zowel academisch als industrieel onderzoek. Daarom bestaat er een toenemende en duurzame behoefte aan goed opgeleide en kennisrijke onderzoekers die ook de taal van de andere vakgebieden kunnen begrijpen en spreken“, zegt Prof. Dr. Roderich Süssmuth.

Naast de TU Berlijn zijn ook in de tweede financieringsperiode de FU Berlijn, de HU Berlijn, de Universiteit Potsdam en het onderzoeksinstituut voor Moleculaire Farmacologie in Berlijn-Buch betrokken bij de graduate school. Het docentenkorps wordt aangevuld met bijdragen van internationaal gerenommeerde peptidwetenschappers van universiteiten en uit de industrie. Ervaren senior-wetenschappers fungeren als adviseurs binnen de graduate school.

Voor meer informatie kunt u contact opnemen:

Prof. Dr. Roderich Süssmuth
TU Berlijn
Vakgebied Biologische Chemie
Tel.: 030/314-24205
E-mail: roderich.suessmuth@tu-berlin.de

Maria Seidel
TU Berlijn
Vakgebied Biologische Chemie
Tel.: 030/314-73742
E-mail: maria.seidel@tu-berlin.de